Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms