Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms