Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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