Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms