Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms