Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM25Q14258 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM25Q14258 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM25Q14258 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM25Q14258 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM25Q14258 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM25Q14258 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM25Q14258 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms