Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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DNASE1L3Q13609 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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DNASE1L3Q13609 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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DNASE1L3Q13609 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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DNASE1L3Q13609 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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