Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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