Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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