Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms