Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CLN3Q13286 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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