Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms