Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms