Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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EFEMP1Q12805 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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