Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms