Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms