Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms