Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms