Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKP1P63208 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP1P63208 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP1P63208 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP1P63208 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms