Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms