Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM11AP58511 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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