Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms