Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms