Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms