Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IQGAP1P46940 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms