Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms