Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms