Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB2P29033 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB2P29033 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms