Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXP28300 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXP28300 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXP28300 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXP28300 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXP28300 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXP28300 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXP28300 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXP28300 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXP28300 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXP28300 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXP28300 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXP28300 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXP28300 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXP28300 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXP28300 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXP28300 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms