Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LMO1P25800 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LMO1P25800 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LMO1P25800 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LMO1P25800 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO1P25800 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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