Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms