Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMPD1P23109 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms