Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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