Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPB42P16452 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPB42P16452 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms