Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms