Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms