Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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