Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI3P10071 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI3P10071 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI3P10071 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms