Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM58BPP0C7Q3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM58BPP0C7Q3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM58BPP0C7Q3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM58BPP0C7Q3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM58BPP0C7Q3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FAM58BPP0C7Q3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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