Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOP08100 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHOP08100 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RHOP08100 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHOP08100 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHOP08100 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOP08100 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms