Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIX3O95343 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIX3O95343 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIX3O95343 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIX3O95343 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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