Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP290O15078 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP290O15078 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP290O15078 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP290O15078 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP290O15078 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP290O15078 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP290O15078 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP290O15078 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CEP290O15078 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP290O15078 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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