Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms