Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms