Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms