Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms