Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms