Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
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