Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXND1Q9Y4D7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXND1Q9Y4D7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms