Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms